8.6.65 - Released: 2024-12-04 - Content: 270195 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_47700
Cell Name :  pcd4_2_2
Archive Name :  Hamad
Species Name :  rat
Strain :  Long-Evans
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  0.0 day
Max Age :  1.0 day
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  neonatal
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, deep
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  TARP Gamma-2
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 50% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-10-20
Date of Upload :  2016-09-01
Persistence Vector :  pcd4_2_2.pvec
Note :  organotypic culture transfeted at 10 DIV and fixed at 15 DIV

Reference Article
Related Article Reference :  Type I TARPs promote dendritic growth of early postnatal neocortical pyramidal cells in organotypic cultures.

Measurements
Soma Surface :  4160.8 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  29
Overall Width :  125.43 μm
Overall Height :  253.96 μm
Overall Depth :  3.95 μm
Average Diameter :  0.07 μm
Total Length :  1560.86 μm
Total Surface :  343.25 μm2
Total Volume :  6.01 μm3
Max Euclidean Distance :  213.51 μm
Max Path Distance :  262.36 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  688
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  68.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.77°
Fractal Dimension :  1.05

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