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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_93461
Cell Name :  young-tbi-9
Archive Name :  Loane
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  22 grams
Max Weight :  26 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Traumatic brain injury
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-12-22
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  young-tbi-9.pvec
Note :  Ipsilateral TBI

Reference Article
Related Article Reference :  Traumatic brain injury in aged animals increases lesion size and chronically alters microglial/macrophage classical and alternative activation states.

Measurements
Soma Surface :  140.76 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  24
Overall Width :  52.52 μm
Overall Height :  15.74 μm
Overall Depth :  1.31 μm
Average Diameter :  0.31 μm
Total Length :  190.22 μm
Total Surface :  188.35 μm2
Total Volume :  24.77 μm3
Max Euclidean Distance :  43.35 μm
Max Path Distance :  67.9 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  180
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  4.36
Average Bifurcation Angle Local :  81.49°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.59°
Fractal Dimension :  1.04

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