8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_93453
Cell Name :  young-tbi-22
Archive Name :  Loane
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  22 grams
Max Weight :  26 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Traumatic brain injury
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-12-22
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  young-tbi-22.pvec
Note :  Ipsilateral TBI

Reference Article
Related Article Reference :  Traumatic brain injury in aged animals increases lesion size and chronically alters microglial/macrophage classical and alternative activation states.

Measurements
Soma Surface :  152.62 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  6
Overall Width :  20.08 μm
Overall Height :  9.71 μm
Overall Depth :  0.3 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  39.46 μm
Total Surface :  35.89 μm2
Total Volume :  3.52 μm3
Max Euclidean Distance :  15.3 μm
Max Path Distance :  17.1 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  37
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  104.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  115.06°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website