8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_177349
Cell Name :  wildtype9
Archive Name :  Ghosh
Species Name :  mouse
Strain :  CaMK2aCreERt2; Tcf4+/+; Thy1-EGFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  120  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2022-01-07
Date of Upload :  2022-02-03
Persistence Vector :  wildtype9.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adult brain neurons require continual expression of the schizophrenia-risk gene Tcf4 for structural and functional integrity.

Measurements
Soma Surface :  787.16 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  25
Overall Width :  108.77 μm
Overall Height :  260.69 μm
Overall Depth :  29.85 μm
Average Diameter :  0.54 μm
Total Length :  1169.13 μm
Total Surface :  1983.37 μm2
Total Volume :  267.75 μm3
Max Euclidean Distance :  288.25 μm
Max Path Distance :  307.32 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  359
Partition Asymmetry :  0.7
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  64.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.22°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website