8.6.88 - Released: 2025-08-26 - Content: 278255 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_135823
Cell Name :  ttL5_V2_cell1
Archive Name :  Rancz
Species Name :  mouse
Strain :  Tg(Colgalt2-Cre)NF107Gsat
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.5 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  secondary visual, layer 5 medial left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Thick-tufted, lateral posterior thalamic nucleus-projecting
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  2000x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-06-14
Date of Upload :  2020-07-24
Persistence Vector :  ttL5_V2_cell1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Apical length governs computational diversity of layer 5 pyramidal neurons.

Measurements
Soma Surface :  497.38 μm2
Number of Stems :  13
Number of Bifurcations :  72
Number of Branches :  157
Overall Width :  232.62 μm
Overall Height :  533.38 μm
Overall Depth :  100.26 μm
Average Diameter :  0.57 μm
Total Length :  7018.88 μm
Total Surface :  12569.1 μm2
Total Volume :  1791.16 μm3
Max Euclidean Distance :  452.23 μm
Max Path Distance :  608.63 μm
Max Branch Order :  27
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  2323
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  82.71°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.26°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website