8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_135831
Cell Name :  ttL5_V1_cell3
Archive Name :  Rancz
Species Name :  mouse
Strain :  Tg(Colgalt2-Cre)NF107Gsat
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.5 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5 left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Thick-tufted, lateral posterior thalamic nucleus-projecting
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-06-14
Date of Upload :  2020-07-24
Persistence Vector :  ttL5_V1_cell3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Apical length governs computational diversity of layer 5 pyramidal neurons.

Measurements
Soma Surface :  938.35 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  91
Number of Branches :  189
Overall Width :  237.91 μm
Overall Height :  945.7 μm
Overall Depth :  195.84 μm
Average Diameter :  0.57 μm
Total Length :  10860.1 μm
Total Surface :  19442.3 μm2
Total Volume :  2770.17 μm3
Max Euclidean Distance :  675.03 μm
Max Path Distance :  932.5 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  14685
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.99
Average Bifurcation Angle Local :  85.71°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.58°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website