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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66243
Cell Name :  traced-WT-Male-hippo-147-5a
Archive Name :  Lein
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-17
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  traced-WT-Male-hippo-147-5a.pvec
Note :  Basal trees only

Reference Article
Related Article Reference :  Valid statistical approaches for analyzing sholl data: Mixed effects versus simple linear models.

Measurements
Soma Surface :  42.88 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  30
Overall Width :  47.19 μm
Overall Height :  87.14 μm
Overall Depth :  36.92 μm
Average Diameter :  0.4 μm
Total Length :  570.18 μm
Total Surface :  716.51 μm2
Total Volume :  71.65 μm3
Max Euclidean Distance :  68.32 μm
Max Path Distance :  88.61 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  106
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  99.47°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.67°
Fractal Dimension :  1.03

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