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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66241
Cell Name :  traced-WT-Male-hippo-147-4
Archive Name :  Lein
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-17
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  traced-WT-Male-hippo-147-4.pvec
Note :  Basal trees only

Reference Article
Related Article Reference :  Valid statistical approaches for analyzing sholl data: Mixed effects versus simple linear models.

Measurements
Soma Surface :  62.42 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  39
Overall Width :  88.78 μm
Overall Height :  142.38 μm
Overall Depth :  32.11 μm
Average Diameter :  0.32 μm
Total Length :  1251.39 μm
Total Surface :  1258.04 μm2
Total Volume :  100.64 μm3
Max Euclidean Distance :  141.87 μm
Max Path Distance :  167.5 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  184
Partition Asymmetry :  0.3
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  75.86°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.91°
Fractal Dimension :  1.02

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