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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66238
Cell Name :  traced-WT-Male-hippo-124-7b
Archive Name :  Lein
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-17
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  traced-WT-Male-hippo-124-7b.pvec
Note :  Basal trees only

Reference Article
Related Article Reference :  Valid statistical approaches for analyzing sholl data: Mixed effects versus simple linear models.

Measurements
Soma Surface :  24081.5 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  24
Overall Width :  103.02 μm
Overall Height :  70.9 μm
Overall Depth :  39.66 μm
Average Diameter :  0.4 μm
Total Length :  650.46 μm
Total Surface :  817.39 μm2
Total Volume :  81.74 μm3
Max Euclidean Distance :  78.28 μm
Max Path Distance :  104.52 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  61
Partition Asymmetry :  0.27
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  48.98°
Average Bifurcation Angle Remote :  38.06°
Fractal Dimension :  1.01

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