8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66200
Cell Name :  traced-WT-Female-hippo-122-7
Archive Name :  Lein
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-17
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  traced-WT-Female-hippo-122-7.pvec
Note :  Basal trees only

Reference Article
Related Article Reference :  Valid statistical approaches for analyzing sholl data: Mixed effects versus simple linear models.

Measurements
Soma Surface :  34747.8 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  39
Overall Width :  67.21 μm
Overall Height :  131.25 μm
Overall Depth :  48.74 μm
Average Diameter :  0.32 μm
Total Length :  908.22 μm
Total Surface :  913.04 μm2
Total Volume :  73.04 μm3
Max Euclidean Distance :  100.97 μm
Max Path Distance :  125.79 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  130
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  95.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.04°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website