8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_63206
Cell Name :  trace509
Archive Name :  Carvalho
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Ser12-mutated pathogenic human atx3 transfection
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-05
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  trace509.pvec
Note :  14-15 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Ataxin-3 phosphorylation decreases neuronal defects in spinocerebellar ataxia type 3 models.

Measurements
Soma Surface :  26.65 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  40
Overall Width :  83.14 μm
Overall Height :  95.44 μm
Overall Depth :  2.75 μm
Average Diameter :  0.62 μm
Total Length :  573.98 μm
Total Surface :  1104.95 μm2
Total Volume :  172.37 μm3
Max Euclidean Distance :  79.74 μm
Max Path Distance :  90.44 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  289
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  111.04°
Average Bifurcation Angle Remote :  94.18°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website