8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_63239
Cell Name :  trace205
Archive Name :  Carvalho
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-05
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  trace205.pvec
Note :  14-15 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Ataxin-3 phosphorylation decreases neuronal defects in spinocerebellar ataxia type 3 models.

Measurements
Soma Surface :  10938.1 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  51
Number of Branches :  110
Overall Width :  141.08 μm
Overall Height :  212.54 μm
Overall Depth :  5.32 μm
Average Diameter :  0.64 μm
Total Length :  1666.3 μm
Total Surface :  3314.54 μm2
Total Volume :  527.26 μm3
Max Euclidean Distance :  157.68 μm
Max Path Distance :  174.13 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  911
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  90.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.07°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website