8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_131231
Cell Name :  tr_17_0
Archive Name :  Chen_Zhao
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-YFP-H
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  22 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  parietal
Tertiary Brain Region :  layer 5, posterior association area
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  NeuroGPS-Tree.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  NeuroGPS-Tree
Date of Deposition :  2020-02-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  tr_17_0.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Evaporative water loss in box turtles: effects of rostral brainstem and other temperatures.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  24
Overall Width :  58.74 μm
Overall Height :  213.96 μm
Overall Depth :  72.06 μm
Average Diameter :  2.46 μm
Total Length :  635.43 μm
Total Surface :  4977.91 μm2
Total Volume :  3318.38 μm3
Max Euclidean Distance :  196.48 μm
Max Path Distance :  205.1 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1531
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  50.19
Average Bifurcation Angle Local :  60.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.02°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website