8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_192465
Cell Name :  sup_CSB096_PFC_c
Archive Name :  MacAskill
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  ventral, pyramidal layer, superficial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  prefrontal cortex (PFC)-projecting
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2022-06-17
Date of Upload :  2022-07-07
Persistence Vector :  sup_CSB096_PFC_c.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Two opposing hippocampus to prefrontal cortex pathways for the control of approach and avoidance behaviour.

Measurements
Soma Surface :  229.89 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  55
Overall Width :  179.36 μm
Overall Height :  359.63 μm
Overall Depth :  184.52 μm
Average Diameter :  1.27 μm
Total Length :  3038.93 μm
Total Surface :  12463.9 μm2
Total Volume :  4243.73 μm3
Max Euclidean Distance :  361.49 μm
Max Path Distance :  460 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  566
Partition Asymmetry :  0.69
Average Rall's Ratio :  1.57
Average Bifurcation Angle Local :  69.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.3°
Fractal Dimension :  1.04

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