8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78849
Cell Name :  slice-9_1
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  slice-9_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  101.78 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  30
Overall Width :  60.69 μm
Overall Height :  19.9 μm
Overall Depth :  3.31 μm
Average Diameter :  1.19 μm
Total Length :  210.86 μm
Total Surface :  781.05 μm2
Total Volume :  240.58 μm3
Max Euclidean Distance :  31.98 μm
Max Path Distance :  50.54 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  125
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  98.99°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.87°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website