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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78941
Cell Name :  slice-4_25
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  LPS-triggered
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  slice-4_25.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  367.85 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  24
Overall Width :  39.44 μm
Overall Height :  25.87 μm
Overall Depth :  6.74 μm
Average Diameter :  1.24 μm
Total Length :  255.7 μm
Total Surface :  992.15 μm2
Total Volume :  341.49 μm3
Max Euclidean Distance :  28.08 μm
Max Path Distance :  34.58 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  145
Partition Asymmetry :  0.19
Average Rall's Ratio :  2.39
Average Bifurcation Angle Local :  100.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.84°
Fractal Dimension :  1.07

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