8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_274171
Cell Name :  sl5-0009_06
Archive Name :  Hatchell_Tomlinson
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  Periventricular region
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2023-04-11
Date of Upload :  2023-10-03
Persistence Vector :  sl5-0009_06.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A Role for P-selectin and Complement in the Pathological Sequelae of Germinal Matrix Hemorrhage.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  52
Overall Width :  13.15 μm
Overall Height :  49 μm
Overall Depth :  19.34 μm
Average Diameter :  0.49 μm
Total Length :  272.04 μm
Total Surface :  419.55 μm2
Total Volume :  59.84 μm3
Max Euclidean Distance :  30.85 μm
Max Path Distance :  57.14 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  1758
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  1.8
Average Bifurcation Angle Local :  72.98°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.82°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website