8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_274236
Cell Name :  sl4-0008_03
Archive Name :  Hatchell_Tomlinson
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  Periventricular region
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2023-04-11
Date of Upload :  2023-10-03
Persistence Vector :  sl4-0008_03.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A Role for P-selectin and Complement in the Pathological Sequelae of Germinal Matrix Hemorrhage.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  90
Overall Width :  12.24 μm
Overall Height :  34.58 μm
Overall Depth :  19.01 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  303.29 μm
Total Surface :  488.05 μm2
Total Volume :  76.9 μm3
Max Euclidean Distance :  37.63 μm
Max Path Distance :  53.74 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1920
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2.01
Average Bifurcation Angle Local :  75.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  89.06°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website