8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_274231
Cell Name :  sl2-0004_01
Archive Name :  Hatchell_Tomlinson
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  Periventricular region
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  collagenase injection
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2023-04-11
Date of Upload :  2023-10-03
Persistence Vector :  sl2-0004_01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A Role for P-selectin and Complement in the Pathological Sequelae of Germinal Matrix Hemorrhage.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  118
Number of Branches :  238
Overall Width :  13.09 μm
Overall Height :  53.88 μm
Overall Depth :  21.85 μm
Average Diameter :  1.05 μm
Total Length :  609.77 μm
Total Surface :  2056 μm2
Total Volume :  636.63 μm3
Max Euclidean Distance :  38.46 μm
Max Path Distance :  60.03 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  3525
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2.04
Average Bifurcation Angle Local :  51.87°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.39°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website