8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_110883
Cell Name :  sigma-5
Archive Name :  Sreenath
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2019-04-23
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  sigma-5.pvec
Note :  7 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  BDNF Induced Translation of Limk1 in Developing Neurons Regulates Dendrite Growth by Fine-Tuning Cofilin1 Activity.

Measurements
Soma Surface :  2136.25 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  17
Overall Width :  128.46 μm
Overall Height :  163.22 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  667.27 μm
Total Surface :  2096.29 μm2
Total Volume :  524.07 μm3
Max Euclidean Distance :  115.59 μm
Max Path Distance :  121.7 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  113
Partition Asymmetry :  0.2
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  71.43°
Average Bifurcation Angle Remote :  38.62°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website