8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_93613
Cell Name :  sema3a-sholl011_1-b
Archive Name :  Makihara_Goshima
Species Name :  mouse
Strain :  transgenic
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 5
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  sema3a-/-
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2017-12-11
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  sema3a-sholl011_1-b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  CRMP1 and CRMP2 have synergistic but distinct roles in dendritic development.

Measurements
Soma Surface :  87.43 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  27
Overall Width :  73.06 μm
Overall Height :  79.63 μm
Overall Depth :  1.17 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  385.84 μm
Total Surface :  303.04 μm2
Total Volume :  18.94 μm3
Max Euclidean Distance :  58.94 μm
Max Path Distance :  68.42 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1964
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  73.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.4°
Fractal Dimension :  1.04

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