8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_190125
Cell Name :  s3caudatevimcell1
Archive Name :  Mechawar
Species Name :  human
Strain :  Not applicable
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  32.0 years
Max Age :  32.0 years
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  dorsal nucleus, caudate (precommisural level)
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  GFAP-positive, Vimentin-immunoreactive (VIM-IR)
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-01-27
Date of Upload :  2022-06-13
Persistence Vector :  s3caudatevimcell1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Widespread Decrease of Cerebral Vimentin-Immunoreactive Astrocytes in Depressed Suicides.

Measurements
Soma Surface :  377.44 μm2
Number of Stems :  23
Number of Bifurcations :  66
Number of Branches :  155
Overall Width :  106.98 μm
Overall Height :  62.64 μm
Overall Depth :  14.17 μm
Average Diameter :  0.21 μm
Total Length :  2350.9 μm
Total Surface :  1632.8 μm2
Total Volume :  109.49 μm3
Max Euclidean Distance :  89.16 μm
Max Path Distance :  112.28 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  2652
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  1.42
Average Bifurcation Angle Local :  67.93°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.78°
Fractal Dimension :  1.1

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website