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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_08613
Cell Name :  s120509s1
Archive Name :  Capogna
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  22.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  main intercalated nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  projection
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-02-29
Date of Upload :  2013-01-15
Persistence Vector :  s120509s1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Functional connectivity of the main intercalated nucleus of the mouse amygdala.

Measurements
Soma Surface :  915 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  62
Number of Branches :  130
Overall Width :  776.58 μm
Overall Height :  665.78 μm
Overall Depth :  30.44 μm
Average Diameter :  0.18 μm
Total Length :  6162.53 μm
Total Surface :  3523.55 μm2
Total Volume :  160.32 μm3
Max Euclidean Distance :  587.18 μm
Max Path Distance :  1665.42 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1835
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  90.67°
Average Bifurcation Angle Remote :  80°
Fractal Dimension :  1.05

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