8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108659
Cell Name :  recon_1_split_12
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  Wildtype
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 months
Max Age :  12.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  34 grams
Max Weight :  34 grams
Development :  old
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  recon_1_split_12.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  335.44 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  40
Number of Branches :  82
Overall Width :  101.54 μm
Overall Height :  94.07 μm
Overall Depth :  33.59 μm
Average Diameter :  1.49 μm
Total Length :  1297.37 μm
Total Surface :  5886.81 μm2
Total Volume :  2630.12 μm3
Max Euclidean Distance :  86.49 μm
Max Path Distance :  114.83 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  339
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2.51
Average Bifurcation Angle Local :  76.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.57°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website