8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108767
Cell Name :  recon_14
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  zQ175 heterozygous
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 months
Max Age :  12.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  old
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  recon_14.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  608.06 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  33
Overall Width :  68.03 μm
Overall Height :  114.08 μm
Overall Depth :  34.57 μm
Average Diameter :  2.51 μm
Total Length :  701.46 μm
Total Surface :  4910.97 μm2
Total Volume :  4335.05 μm3
Max Euclidean Distance :  77.82 μm
Max Path Distance :  94.74 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  186
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2.58
Average Bifurcation Angle Local :  64.37°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.63°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website