8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_05734
Cell Name :  py-300608
Archive Name :  Korngreen
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2009-09-02
Date of Upload :  2010-11-05
Persistence Vector :  py-300608.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Space-clamp problems when voltage clamping neurons expressing voltage-gated conductances.

Measurements
Soma Surface :  1963.34 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  98
Overall Width :  250.94 μm
Overall Height :  1138.34 μm
Overall Depth :  165.85 μm
Average Diameter :  1.42 μm
Total Length :  8854.09 μm
Total Surface :  38652.19 μm2
Total Volume :  18418.7 μm3
Max Euclidean Distance :  1032.82 μm
Max Path Distance :  1265.75 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  2065
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.58
Average Bifurcation Angle Local :  76.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.39°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website