8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_296666
Cell Name :  n6
Archive Name :  Cai
Species Name :  mouse
Strain :  PV-Cre; SOM-Cre
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  56.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Calbindin (CB)-positive
Original Format :  nTracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Brainbow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected (no values given)
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  nTracer
Date of Deposition :  2025-03-01
Date of Upload :  2025-04-02
Persistence Vector :  n6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Light microscopy based approach for mapping connectivity with molecular specificity.

Measurements
Soma Surface :  25094.8 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  30
Overall Width :  1059.52 μm
Overall Height :  1958.49 μm
Overall Depth :  439 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  12890 μm
Total Surface :  10123.8 μm2
Total Volume :  632.74 μm3
Max Euclidean Distance :  2067.02 μm
Max Path Distance :  2623.95 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  9388
Partition Asymmetry :  0.36
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  42.05°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.73°
Fractal Dimension :  1.05

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