8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07652
Cell Name :  n22TTKO
Archive Name :  Lee
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/TrkB.T1 deficient
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  29 grams
Max Weight :  36 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2011-10-21
Date of Upload :  2012-05-17
Persistence Vector :  n22TTKO.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Endogenous truncated TrkB.T1 receptor regulates neuronal complexity and TrkB kinase receptor function in vivo

Measurements
Soma Surface :  557.05 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  17
Overall Width :  182.15 μm
Overall Height :  213.54 μm
Overall Depth :  50.15 μm
Average Diameter :  1.16 μm
Total Length :  1681.62 μm
Total Surface :  5797.26 μm2
Total Volume :  1683.17 μm3
Max Euclidean Distance :  250.04 μm
Max Path Distance :  284.91 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  231
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.45
Average Bifurcation Angle Local :  65.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  30.6°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website