8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07638
Cell Name :  n16TTKO
Archive Name :  Lee
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/TrkB.T1 deficient
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  29 grams
Max Weight :  36 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2011-10-21
Date of Upload :  2012-05-17
Persistence Vector :  n16TTKO.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Endogenous truncated TrkB.T1 receptor regulates neuronal complexity and TrkB kinase receptor function in vivo

Measurements
Soma Surface :  899.85 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  25
Overall Width :  132.79 μm
Overall Height :  172.07 μm
Overall Depth :  114.83 μm
Average Diameter :  1.41 μm
Total Length :  2178.14 μm
Total Surface :  9963.42 μm2
Total Volume :  3839.64 μm3
Max Euclidean Distance :  213.28 μm
Max Path Distance :  306.42 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  454
Partition Asymmetry :  0.19
Average Rall's Ratio :  1.52
Average Bifurcation Angle Local :  75.89°
Average Bifurcation Angle Remote :  33.68°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website