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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102024
Cell Name :  ms90_slice3
Archive Name :  Mikhaylova
Species Name :  mouse
Strain :  129/SVE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  9.0 days
Max Age :  9.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Caldendrin knockout
Staining Method :  mRuby2
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2018-08-13
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  ms90_slice3.pvec
Note :  Organotypic slices 4 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Caldendrin Directly Couples Postsynaptic Calcium Signals to Actin Remodeling in Dendritic Spines.

Measurements
Soma Surface :  1324.12 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  73
Number of Branches :  148
Overall Width :  132.36 μm
Overall Height :  326.47 μm
Overall Depth :  25.18 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  3428.73 μm
Total Surface :  2692.92 μm2
Total Volume :  168.31 μm3
Max Euclidean Distance :  285.34 μm
Max Path Distance :  334.76 μm
Max Branch Order :  24
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  6087
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  34.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  47.86°
Fractal Dimension :  1.06

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