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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102017
Cell Name :  ms89_slice1_px
Archive Name :  Mikhaylova
Species Name :  mouse
Strain :  129/SVE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  9.0 days
Max Age :  9.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Caldendrin knockout
Staining Method :  mRuby2
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2018-08-13
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  ms89_slice1_px.pvec
Note :  Organotypic slices 4 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Caldendrin Directly Couples Postsynaptic Calcium Signals to Actin Remodeling in Dendritic Spines.

Measurements
Soma Surface :  3040.53 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  60
Number of Branches :  124
Overall Width :  150.12 μm
Overall Height :  726.69 μm
Overall Depth :  28.97 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  4950.88 μm
Total Surface :  3888.41 μm2
Total Volume :  243.03 μm3
Max Euclidean Distance :  628.78 μm
Max Path Distance :  777.43 μm
Max Branch Order :  25
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  4324
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  84.54°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.11°
Fractal Dimension :  1.05

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