8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102004
Cell Name :  ms88_slice3_cell1
Archive Name :  Mikhaylova
Species Name :  mouse
Strain :  129/SVE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  9.0 days
Max Age :  9.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  mRuby2
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2018-08-13
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  ms88_slice3_cell1.pvec
Note :  Organotypic slices 4 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Caldendrin Directly Couples Postsynaptic Calcium Signals to Actin Remodeling in Dendritic Spines.

Measurements
Soma Surface :  564.95 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  38
Number of Branches :  79
Overall Width :  107.59 μm
Overall Height :  249.46 μm
Overall Depth :  34.24 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2115.09 μm
Total Surface :  1661.19 μm2
Total Volume :  103.82 μm3
Max Euclidean Distance :  209.53 μm
Max Path Distance :  270.94 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  3569
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  57.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.92°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website