8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102002
Cell Name :  ms88_slice1_cell2
Archive Name :  Mikhaylova
Species Name :  mouse
Strain :  129/SVE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  9.0 days
Max Age :  9.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  mRuby2
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2018-08-13
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  ms88_slice1_cell2.pvec
Note :  Organotypic slices 4 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Caldendrin Directly Couples Postsynaptic Calcium Signals to Actin Remodeling in Dendritic Spines.

Measurements
Soma Surface :  1304.84 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  66
Number of Branches :  134
Overall Width :  82.76 μm
Overall Height :  350.13 μm
Overall Depth :  24.92 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  3007.08 μm
Total Surface :  2361.75 μm2
Total Volume :  147.61 μm3
Max Euclidean Distance :  273.31 μm
Max Path Distance :  326.91 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  5357
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  35.87°
Average Bifurcation Angle Remote :  48.6°
Fractal Dimension :  1.06

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