8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_189689
Cell Name :  ms5vimpfccell2
Archive Name :  Mechawar
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  association cortex
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  GFAP-positive, Vimentin-immunoreactive (VIM-IR)
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-08-30
Date of Upload :  2022-06-13
Persistence Vector :  ms5vimpfccell2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Characterization of Vimentin-Immunoreactive Astrocytes in the Human Brain.

Measurements
Soma Surface :  151.74 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  33
Overall Width :  36.28 μm
Overall Height :  31.46 μm
Overall Depth :  8.96 μm
Average Diameter :  0.24 μm
Total Length :  343.43 μm
Total Surface :  271.56 μm2
Total Volume :  20.89 μm3
Max Euclidean Distance :  30.43 μm
Max Path Distance :  32.89 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  264
Partition Asymmetry :  0.27
Average Rall's Ratio :  1.83
Average Bifurcation Angle Local :  70.86°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.86°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website