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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_189990
Cell Name :  ms5vimcaudcell1
Archive Name :  Mechawar
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Putamen, caudate (precommisural level)
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  GFAP-positive, Vimentin-immunoreactive (VIM-IR)
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-08-30
Date of Upload :  2022-06-13
Persistence Vector :  ms5vimcaudcell1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Characterization of Vimentin-Immunoreactive Astrocytes in the Human Brain.

Measurements
Soma Surface :  144.48 μm2
Number of Stems :  21
Number of Bifurcations :  42
Number of Branches :  105
Overall Width :  61.25 μm
Overall Height :  35.83 μm
Overall Depth :  14.32 μm
Average Diameter :  0.18 μm
Total Length :  1108.1 μm
Total Surface :  653.79 μm2
Total Volume :  36.9 μm3
Max Euclidean Distance :  38.08 μm
Max Path Distance :  66.52 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  913
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  70.39°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.77°
Fractal Dimension :  1.09

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