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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_189949
Cell Name :  ms3vimcaudcell1
Archive Name :  Mechawar
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Putamen, caudate (precommisural level)
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  GFAP-positive, Vimentin-immunoreactive (VIM-IR)
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-08-30
Date of Upload :  2022-06-13
Persistence Vector :  ms3vimcaudcell1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Characterization of Vimentin-Immunoreactive Astrocytes in the Human Brain.

Measurements
Soma Surface :  145.36 μm2
Number of Stems :  13
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  53
Overall Width :  35.45 μm
Overall Height :  29.97 μm
Overall Depth :  15.84 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  534.41 μm
Total Surface :  437.44 μm2
Total Volume :  37.5 μm3
Max Euclidean Distance :  34.29 μm
Max Path Distance :  49.3 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  507
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  4.09
Average Bifurcation Angle Local :  74.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  50.46°
Fractal Dimension :  1.07

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