8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108711
Cell Name :  modified_3826_1_1035_5_split_1
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  zQ175 heterozygous
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  modified_3826_1_1035_5_split_1.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  151.53 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  51
Overall Width :  225.21 μm
Overall Height :  194.45 μm
Overall Depth :  97.37 μm
Average Diameter :  1.62 μm
Total Length :  3572.57 μm
Total Surface :  17920.7 μm2
Total Volume :  8754.12 μm3
Max Euclidean Distance :  322.58 μm
Max Path Distance :  506.44 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  774
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  63.93°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.82°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website