8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108716
Cell Name :  modified_3826_1_1035_4_split_2
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  zQ175 heterozygous
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  modified_3826_1_1035_4_split_2.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  435.79 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  40
Overall Width :  134.84 μm
Overall Height :  143.59 μm
Overall Depth :  56.67 μm
Average Diameter :  1.55 μm
Total Length :  1435.62 μm
Total Surface :  6322.94 μm2
Total Volume :  3080.55 μm3
Max Euclidean Distance :  140.19 μm
Max Path Distance :  182 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  332
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.87
Average Bifurcation Angle Local :  69.45°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.15°
Fractal Dimension :  1.07

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