8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108705
Cell Name :  modified_3826_1_1035_4_split_1
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  zQ175 heterozygous
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  modified_3826_1_1035_4_split_1.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  606.81 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  26
Overall Width :  123.1 μm
Overall Height :  199.64 μm
Overall Depth :  56.04 μm
Average Diameter :  1.66 μm
Total Length :  1417.56 μm
Total Surface :  6452.69 μm2
Total Volume :  4201.24 μm3
Max Euclidean Distance :  156.64 μm
Max Path Distance :  235.48 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  321
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.66
Average Bifurcation Angle Local :  58.89°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.53°
Fractal Dimension :  1.08

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