8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108719
Cell Name :  modified_3826_1_1035_2_split_31
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  zQ175 heterozygous
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  modified_3826_1_1035_2_split_31.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  321.89 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  26
Overall Width :  148.07 μm
Overall Height :  194.17 μm
Overall Depth :  47.57 μm
Average Diameter :  1.31 μm
Total Length :  1371.43 μm
Total Surface :  5540.3 μm2
Total Volume :  2547.32 μm3
Max Euclidean Distance :  129.85 μm
Max Path Distance :  152.72 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  297
Partition Asymmetry :  0.2
Average Rall's Ratio :  2.09
Average Bifurcation Angle Local :  77.85°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.85°
Fractal Dimension :  1.05

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