8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_158905
Cell Name :  medial_mediodorsal_thalamus
Archive Name :  deKloet_Mansvelder
Species Name :  rat
Strain :  Long-Evans
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  mediodorsal thalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  medial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  Medial prefrontal cortex (MPC)-projecting
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2021-06-16
Date of Upload :  2021-07-09
Persistence Vector :  medial_mediodorsal_thalamus.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Bi-directional regulation of cognitive control by distinct prefrontal cortical output neurons to thalamus and striatum.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  43
Number of Branches :  88
Overall Width :  324.88 μm
Overall Height :  487.4 μm
Overall Depth :  70 μm
Average Diameter :  3.19 μm
Total Length :  7509 μm
Total Surface :  78883 μm2
Total Volume :  91671.1 μm3
Max Euclidean Distance :  362.87 μm
Max Path Distance :  459.49 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  2670
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  3.73
Average Bifurcation Angle Local :  94.48°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.72°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website