8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07584
Cell Name :  large-basket
Archive Name :  Kubota
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  19.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  basket
Tertiary Cell Class :  Large
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  oblique horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 90%
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2011-07-12
Date of Upload :  2012-05-17
Persistence Vector :  large-basket.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Conserved properties of dendritic trees in four cortical interneuron subtypes.

Measurements
Soma Surface :  1146.79 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  116
Number of Branches :  238
Overall Width :  346.52 μm
Overall Height :  577.15 μm
Overall Depth :  147.46 μm
Average Diameter :  0.54 μm
Total Length :  18361.59 μm
Total Surface :  30607.5 μm2
Total Volume :  6112.42 μm3
Max Euclidean Distance :  443.55 μm
Max Path Distance :  1494.68 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  7506
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2.01
Average Bifurcation Angle Local :  90.43°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.02°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website