8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_11351
Cell Name :  ko20x-12
Archive Name :  Wu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2013-01-31
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  ko20x-12.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Protocadherin clusters and cell adhesion kinase regulate dendrite complexity through Rho GTPase.

Measurements
Soma Surface :  1938.23 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  32
Overall Width :  172.98 μm
Overall Height :  581.05 μm
Overall Depth :  40 μm
Average Diameter :  3.23 μm
Total Length :  1860.57 μm
Total Surface :  19207.4 μm2
Total Volume :  17759.9 μm3
Max Euclidean Distance :  469.75 μm
Max Path Distance :  497.79 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  153
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  7.54
Average Bifurcation Angle Local :  49.9°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.61°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website