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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_11347
Cell Name :  ko20x-04
Archive Name :  Wu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2013-01-31
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  ko20x-04.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Protocadherin clusters and cell adhesion kinase regulate dendrite complexity through Rho GTPase.

Measurements
Soma Surface :  5124.97 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  28
Number of Branches :  60
Overall Width :  172.04 μm
Overall Height :  660.06 μm
Overall Depth :  38 μm
Average Diameter :  3.55 μm
Total Length :  2804.12 μm
Total Surface :  32358.7 μm2
Total Volume :  34387.1 μm3
Max Euclidean Distance :  551.35 μm
Max Path Distance :  572.92 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  227
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  4.45
Average Bifurcation Angle Local :  63.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.5°
Fractal Dimension :  1.01

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