8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_08768
Cell Name :  knock-in-20
Archive Name :  Beguin
Species Name :  mouse
Strain :  Arx(GCG)7-1 KI (B6)
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  17.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knock-in
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-06-27
Date of Upload :  2013-01-15
Persistence Vector :  knock-in-20.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  An Epilepsy-Related ARX Polyalanine Expansion Modifies Glutamatergic Neurons Excitability and Morphology Without Affecting GABAergic Neurons Development.

Measurements
Soma Surface :  312.8 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  93
Overall Width :  262.27 μm
Overall Height :  298.95 μm
Overall Depth :  122 μm
Average Diameter :  0.12 μm
Total Length :  3302.79 μm
Total Surface :  1346.79 μm2
Total Volume :  43.73 μm3
Max Euclidean Distance :  254.95 μm
Max Path Distance :  319.1 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  954
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.98
Average Bifurcation Angle Local :  81.99°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.85°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website