8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_115402
Cell Name :  jy180306_A_idB
Archive Name :  Markram
Species Name :  rat
Strain :  Han Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  35.3 grams
Max Weight :  35.3 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  somatosensory thalamus
Tertiary Brain Region :  ventral posteromedial nucleus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  thalamocortical
Tertiary Cell Class :  relay
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 1.25% in z
Corrected 1.25% in z
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-03-08
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  jy180306_A_idB.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Experimentally-constrained biophysical models of tonic and burst firing modes in thalamocortical neurons.

Measurements
Soma Surface :  1479.22 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  56
Number of Branches :  120
Overall Width :  116.98 μm
Overall Height :  211.27 μm
Overall Depth :  77.45 μm
Average Diameter :  0.85 μm
Total Length :  5003.46 μm
Total Surface :  14329 μm2
Total Volume :  4484.79 μm3
Max Euclidean Distance :  147.32 μm
Max Path Distance :  168.48 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  4287
Partition Asymmetry :  0.37
Average Rall's Ratio :  0.94
Average Bifurcation Angle Local :  83.96°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.28°
Fractal Dimension :  1.04

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