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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_172119
Cell Name :  jy171222_A_idA
Archive Name :  Markram
Species Name :  mouse
Strain :  GAD67-GFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  11.0 days
Max Age :  33.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  ventral posteromedial nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-11-22
Date of Upload :  2022-01-05
Persistence Vector :  jy171222_A_idA.pvec
Note :  Some reconstructions were obtained from horizontal slices.

Reference Article
Related Article Reference :  Morphology, physiology and synaptic connectivity of local interneurons in the mouse somatosensory thalamus.

Measurements
Soma Surface :  1224.8 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  40
Number of Branches :  83
Overall Width :  221.25 μm
Overall Height :  570.59 μm
Overall Depth :  188.14 μm
Average Diameter :  0.78 μm
Total Length :  4722.77 μm
Total Surface :  10909 μm2
Total Volume :  2635.19 μm3
Max Euclidean Distance :  347.87 μm
Max Path Distance :  462.64 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  3605
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.07
Average Bifurcation Angle Local :  84.48°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.26°
Fractal Dimension :  1.05

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