8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_104328
Cell Name :  jekely_708202
Archive Name :  Jekely
Species Name :  Clam worm
Strain :  wild type
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  peripheral nervous system
Secondary Brain Region :  segment 3
Tertiary Brain Region :  left
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  split
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Catmaid.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Osmium tetraoxide
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.05  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Catmaid
Date of Deposition :  2018-10-25
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  jekely_708202.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neural circuitry of a polycystin-mediated hydrodynamic startle response for predator avoidance.

Measurements
Soma Surface :  24.02 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  113
Number of Branches :  228
Overall Width :  5.35 μm
Overall Height :  95.28 μm
Overall Depth :  11.55 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  444.55 μm
Total Surface :  349.15 μm2
Total Volume :  21.82 μm3
Max Euclidean Distance :  67.1 μm
Max Path Distance :  167.93 μm
Max Branch Order :  60
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  1993
Partition Asymmetry :  0.82
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  89.17°
Average Bifurcation Angle Remote :  89.48°
Fractal Dimension :  1.32

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