8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_104431
Cell Name :  jekely_1734547
Archive Name :  Jekely
Species Name :  Clam worm
Strain :  wild type
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  peripheral nervous system
Secondary Brain Region :  ventral nerve cord
Tertiary Brain Region :  decussating trunk, segment 2, left
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Commissural
Tertiary Cell Class :  cross
Original Format :  Catmaid.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Osmium tetraoxide
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.05  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Catmaid
Date of Deposition :  2018-10-25
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  jekely_1734547.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neural circuitry of a polycystin-mediated hydrodynamic startle response for predator avoidance.

Measurements
Soma Surface :  34.39 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  34
Overall Width :  5.44 μm
Overall Height :  55.5 μm
Overall Depth :  16.73 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  161.19 μm
Total Surface :  126.6 μm2
Total Volume :  7.91 μm3
Max Euclidean Distance :  56.89 μm
Max Path Distance :  125.56 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.73
Total Fragmentation :  678
Partition Asymmetry :  0.68
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  99.25°
Average Bifurcation Angle Remote :  100.33°
Fractal Dimension :  1.25

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