8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_104329
Cell Name :  jekely_1545349
Archive Name :  Jekely
Species Name :  Clam worm
Strain :  wild type
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  peripheral nervous system
Secondary Brain Region :  segment 3
Tertiary Brain Region :  left
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  split
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Catmaid.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Osmium tetraoxide
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.05  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Catmaid
Date of Deposition :  2018-10-25
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  jekely_1545349.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neural circuitry of a polycystin-mediated hydrodynamic startle response for predator avoidance.

Measurements
Soma Surface :  42.87 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  98
Number of Branches :  199
Overall Width :  3.8 μm
Overall Height :  20.98 μm
Overall Depth :  45.16 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  244.39 μm
Total Surface :  191.94 μm2
Total Volume :  12 μm3
Max Euclidean Distance :  33.07 μm
Max Path Distance :  62.28 μm
Max Branch Order :  50
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  1270
Partition Asymmetry :  0.76
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  102.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  96.91°
Fractal Dimension :  1.16

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